Eu instalei o eclipse-SDK-3.2-linux-gtk-x86_64.tar.gz (3.2.0) sem problemas, não acredito que o 3.2.1 vá dar problemas. Que eu me lembre a instalação foi só:
cd /usr/local
tar xzvf /onde_foi_baixado/eclipse-SDK-3.2-linux-gtk-x86_64.tar.gz
cd eclipse
./eclipse