ext4, mas para ser um tanto chato, vale lembrar que a decisao de usar o ext4 eh apenas parte de toda uma decisao para o banco de dados, como a tabela que voce vai usar, as configuracoes extras do banco de dados, hardware (HD) e demais configuracoes.
por exemplo, diz a lenda do MySQL que uma boa pratica de performance eh separar cada tabela em um unico arquivo.
kayo.