Dale!!
Eu tive muitos problemas relacionados a propriedades de video e o relacionamento com os aplicativos no ambiente Gnome.
Mesmo com os drivers da ATI rodando ele apresentou muitos problemas e no caso do aMSN, geralmente ele nem abria, encerrava não só o aplicativo mas também a sessão, tendo que logar novamente.
Troquei para o ambiente KDE e normalizou tudo, voltou a rodar sem erros e sem encerramento de aplicativos ou sessão.
Experimenta esta troca para ver o que vai dar!
Abs!